ההבדלים העיקריים בין מאווררי מנהרה למאווררים רגילים הם כדלקמן:
1. שימושים שונים: מאווררי מנהרות משמשים לרוב לאוורור ופליטת פליטות במנהרות, בעוד מאווררים רגילים משמשים לאוורור כללי, קירור, הסרת לחות וכו'.
2. עיצובים שונים: מאווררי מנהרה משתמשים בדרך כלל בממירי אימפלר לוויסות מהירות, חומרים עמידים בפני קורוזיה לייצור, תכנון מיגון אש, תכנון חסין פיצוץ ועיצובים מיוחדים אחרים כדי להבטיח את פעולתם הבטוחה במנהרה; מאווררים רגילים אינם דורשים עיצובים מיוחדים אלה.
3. גדלים שונים: ההספק והנפח של מאווררי המנהרה הם בדרך כלל גדולים יותר ממאווררים רגילים, מכיוון שיכולת האוורור של המנהרות גדולה בהרבה מזו של מקומות רגילים.
4. רמות רעש שונות: מאווררי המנהרה דורשים בדרך כלל רמות רעש נמוכות ככל שהרעש הופך בולט יותר בתוך המנהרה; הרעש של מאווררים רגילים גבוה יחסית.
5. דרגות קושי תחזוקה שונות: מאווררי מנהרות מותקנים בחללים צרים יחסית, דבר המקשה על התחזוקה, אך יש צורך להבטיח את פעולתם התקינה; מאווררים רגילים קלים יחסית לתחזוקה.
