על פי העיקרון של המרת אנרגיה קינטית לאנרגיה פוטנציאלית, מאוורר צנטריפוגלי משתמש באימפלר מסתובב במהירות גבוהה כדי להאיץ גז, ואז להאט ולשנות את כיוון הזרימה, כך שניתן להמיר אנרגיה קינטית לאנרגיה פוטנציאלית (לחץ). במאוורר צנטריפוגלי חד-שלבי, הגז נכנס לדחף מהכיוון הצירי, משתנה לכיוון רדיאלי כאשר הוא עובר דרך האימפלר ואז נכנס למפזר. במפזר הגז משנה את כיוון הזרימה והגדלת שטח חתך הצינור מאטה את הזרימה, מה שהופך אנרגיה קינטית לאנרגיית לחץ. עליית הלחץ מתרחשת בעיקר במדד, ולאחריו תהליך ההתרחבות. במאוורר צנטריפוגלי רב שלבי, נעשה שימוש במכשיר ריפלוקס בכדי לגרום לאוויר לזרום אל הדחף הבא כדי לייצר לחץ גבוה יותר.
עיקרון העבודה של מאוורר צנטריפוגלי זהה למעשה לזה של מדחס הטורבינה, אשר נובע ממהירות הגז הנמוכה ומשינוי לחץ קטן. באופן כללי, אין צורך לקחת בחשבון את שינוי הנפח הספציפי לגז, כלומר הגז מתייחס כנוזל לא דחוס.
ניתן להפוך מאווררים צנטריפוגלים לשני סוגים: יד ימין ושמאל. עם הפנים כלפי מעלה מצד המנוע: הדחף מסתובב עם כיוון השעון, המכונה המאוורר הסיבוב הימני; כאשר הדחף מסתובב נגד כיוון השעון, הוא נקרא המאוורר המסתובב השמאלי.
